本文介绍了水产动物分子标记辅助育种技术的发展。获得与经济性状连锁的标记是开展分子标记辅助育种的基础，因此，本文重点介绍了获得基因/标记技术的进步，探讨了基因/标记与性状间相互关系的复杂性，论述了准确鉴定性状紧密连锁的基因/标记的难度，指出难点主要源于基因组对性状的形成具有非常复杂的影响。近十年来，已有多个利用分子标记辅助育种技术培育的品种在产业上应用，表明这项新技术具有推动产业技术进步的作用；同时指出了分子标记辅助育种包括全基因组选择育种的不足之处，其根本原因在于鱼类性状的形成机制极其复杂、多变，从而决定了分子标记辅助育种技术具有发展阶段论的特征。

为揭示大头鳕TNFSF6基因的基本结构与功能及其在大头鳕发育和神经坏死病毒(Pacific cod nervous necrosis virus， PCNNV)暴发时的响应机制，本研究通过基因克隆获得TNFSF6 cDNA开放阅读框序列，并对序列进行生物信息学分析，运用相对荧光定量PCR(qRT-PCR)方法对TNFSF6在不同组织、孵化后不同日龄仔鱼和PCNNV感染前后仔稚鱼中的表达水平进行检测。结果显示，大头鳕TNFSF6 cDNA长1 388 bp，5′UTR占315bp，3′UTR占500 bp，ORF全长573 bp，编码190个氨基酸。qRT-PCR结果显示，TNFSF6在各组织均有表达，但在脾脏和鳃组织中的表达量较高；大头鳕孵化后15、20、37和40 d TNFSF6基因的转录水平分别是其在5 d转录水平的0.28、0.15、0.12和0.13倍。在24 d和46 d PCNNV暴发时，病鱼TNFSF6基因的转录水平高于对照组；在77 d PCNNV暴发时，病鱼TNFSF6转录水平则显著低于对照组。研究表明，TNFSF6基因在大头鳕发育早期和仔鱼暴发PCNNV时发挥了重要的作用。

随着生活水平的提高，人们对水产品品质提出了更高的要求，因此开发新的加工技术势在必行。冻干食品以其优良的营养品质，易流通、贮藏和方便食用，迎合了这一发展趋势。本文综述了水产品真空冷冻干燥过程中前处理工艺(切片处理、超声波处理、浸渍处理、涂膜处理等)、冻干工艺参数(预冻工艺参数、干燥条件等)、品质变化(感官、质构、营养、风味、滋味、复水性)和品质预测模型的研究现状，并重点探讨水产品真空冷冻干燥技术今后的研发趋势，为水产真空冷冻干燥制品的研究与应用提供参考。

我国是水产资源大国，近年来的水产加工业发展较快，产生了大量水产品加工副产物。其中许多副产物的蛋白质含量较高，可通过酶解得到不同功能性活性肽，进而实现高值化的利用。提高对水产品加工副产物的利用不仅可以减少资源的浪费，提高资源利用率，而且对降低企业成本，增加企业经济效益，减少环境污染也具有重要现实意义。本文主要对水产品加工副产物制备抗氧化肽的来源、抗氧化肽分离纯化方法、抗氧化检测评价方法以及抗氧化肽作用机制的研究进展进行综述。

本研究简要概述了过去几十年来中国水产养殖动物病毒学的代表性研究成果，主要涉及鱼类病毒、虾类病毒、两栖和爬行动物病毒等。此外，本研究还展望了水产动物病毒学研究的发展趋势，以有助于加深对中国水产养殖动物病毒学研究现状和未来发展的认识。

刺激隐核虫是一种原生纤毛类寄生虫，可以感染几乎所有海水硬骨鱼类并导致死亡，给海水鱼类养殖业造成巨大经济损失。由于刺激隐核虫体表寄生的特性，使其成为研究鱼类黏膜免疫机制的良好病原模型，可为高效疫苗的研发提供理论依据。本文综述了鱼类抗刺激隐核虫感染的黏膜免疫研究进展，以期为开展海水鱼类抗刺激隐核虫感染的免疫防控措施研究提供理论支撑。已有研究表明，受刺激隐核虫感染后，斜带石斑鱼皮肤黏液或其培养上清液能使幼虫发生阻动，由皮肤中的抗体分泌细胞产生的特异性IgM抗体在抗寄生虫感染中发挥重要作用；同时在刺激隐核虫感染时，多种免疫细胞如NCC细胞、中性粒细胞等在寄生虫周围聚集，趋化因子以及趋化因子受体表达量在寄生虫感染部位上调，暗示其调节的免疫细胞也参与抗虫免疫；此外，研究发现黄斑蓝子鱼对刺激隐核虫具有天然抗性，其血清和皮肤黏液对刺激隐核虫幼虫和滋养体均具有杀灭作用，已从其血清中分离到一种天然抗虫蛋白—L-氨基酸氧化酶，为刺激隐核虫病的防控提供新的途径；在理论研究的基础上，通过免疫实验证实疫苗防控刺激隐核虫病是可行的。

肠道菌群在维持肠道健康、促进肠道发育、抵抗病原入侵、调节机体能量吸收和脂质代谢过程中均发挥重要作用。在鱼类学研究中，由于种类繁多、食性差异大、生存环境复杂多变，导致鱼类肠道菌群方面的研究面临巨大挑战。本文在总结常见鱼类肠道微生物组成的基础上，着重介绍了鱼类饵料组成、水环境因子、物种、基因型、发育阶段、养殖模式及投喂策略对鱼类肠道菌群影响的相关研究进展，并对目前研究中存在的问题进行了剖析，以期为鱼类肠道菌群研究提供一定的参考依据。

鱼类诺卡氏菌病是一种慢性系统性肉芽肿疾病，鱼诺卡氏菌是其主要病原。鱼诺卡氏菌全基因组生物信息学分析，发现了一个可能靶向定位于宿主细胞线粒体的分泌蛋白——动力蛋白调节蛋白robl/LC7。为了对鱼诺卡氏菌robl/LC7的亚细胞定位和功能进行初步研究，实验对鱼诺卡氏菌robl/LC7进行了基因克隆、真核表达重组质粒构建、分泌蛋白鉴定、亚细胞定位、过表达和凋亡检测。结果显示，成功克隆了鱼诺卡氏菌robl/LC7基因并构建了其真核表达质粒p EGFP-robl/LC7和pc DNA-robl/LC7；鱼诺卡氏菌分泌蛋白质谱鉴定证实robl/LC7为分泌蛋白；亚细胞定位研究显示robl/LC7-GFP融合蛋白呈全细胞分布，不与线粒体共定位；凋亡检测发现robl/LC7过表达能诱导FHM细胞凋亡。研究表明，鱼诺卡氏菌robl/LC7是一个不与线粒体共定位的分泌蛋白，其可能通过参与细胞凋亡调控，协助鱼诺卡氏菌在宿主体内生存和免疫逃避，并在鱼诺卡氏菌的致病过程中具有重要作用。

针对12株引起凡纳滨对虾急性肝胰腺坏死病(AHPND)的致病性副溶血弧菌，运用多位点测序技术，分析致病菌株的遗传特征。实验选择副溶血弧菌的7个管家基因dnaE、gyrB、recA、dtdS、pntA、pyrC及tnaA，对12株AHPND致病菌扩增测序。将核酸序列上传至PubMLST数据库进行比对后获得每株菌的序列型。收集其他地区AHPND致病性副溶血弧菌的多位点序列分型(MLST)数据，采用eBURSTV3及MEGA5.0软件进行遗传进化分析。结果显示，2014年中国广东分离的AHPND致病株属于一个新序列型ST1710(42、134、99、79、141、41、51)，仅与库中ST415及ST975同源性较高。目前，急性肝胰腺坏死致病株的9种ST型可归为2个克隆组和5个单体。经系统发育树进一步分析可知新序列型ST1710与单体ST975遗传关系相近。本研究首次报道中国AHPND分离株的序列型，丰富了PubMLST数据库，并为其遗传进化研究奠定了理论基础。

为探究病害发生后健康与患病凡纳滨对虾肠道菌群结构和功能的差异，并筛选肠道指示菌群来评估宿主健康状况，评价凡纳滨对虾肠道菌落的功能冗余性。实验采集健康和患病凡纳滨对虾样品，通过Illumina高通量测序技术测定肠道菌群组成，并利用PICRUSt进行功能预测，以此比较健康与患病凡纳滨对虾肠道微生物的群落结构和功能差异，并预测功能与群落组成的相关性。结果显示，病害的发生伴随着肠道菌群结构的显著变化，而多样性无显著差异。与健康凡纳滨对虾肠道细菌组成相比，患病凡纳滨对虾肠道中放线菌门(Actinobacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)和疣微菌门(Verrucomicrobia)相对丰度降低，而γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)增加。同时，筛选出16个指示细菌科，能够很好地指示宿主健康状况。与健康组相比，患病凡纳滨对虾中参与弧菌侵染的过程显著增加，而溶酶体和过氧化物酶等免疫功能代谢过程显著减弱。此外，肠道微生物群落结构与功能组成呈显著正相关，表明凡纳滨对虾肠道菌群组成具有较低的功能冗余性。研究表明，健康与患病凡纳滨对虾肠道菌群结构存在显著差异，并且由细菌介导的功能随之发生改变，能够用指示微生物评估宿主健康状况。

为了研究不同健康程度和抗生素氟苯尼考干预下斑石鲷肠道菌群结构的差异及其与养殖环境中菌群结构的相关性，采用Illumina Hi Seq PE250高通量测序的方法对健康、亚健康、典型黑身病和口服氟苯尼考条件下的斑石鲷肠道、养殖水体和颗粒饵料中的细菌多样性及群落结构进行了分析比较。结果显示，养殖水体中细菌多样性高于肠道和颗粒饵料。不同健康程度及氟苯尼考干预下斑石鲷肠道中细菌均以变形菌门、厚壁菌门和软壁菌门为主，且对应的操作分类单元(OTU)占样品全部OTU的比例均达到85%以上。黑身病的发生可影响斑石鲷肠道中丰度最高的前20种优势细菌种类的排名次序，其中变形菌门中的弧菌属的相对丰度显著增加，且随着弧菌属丰度的增加，斑石鲷的黑身病症状也逐渐加重。饵料中添加氟苯尼考投喂斑石鲷能使患病鱼肠道弧菌属的丰度从60.33%下降到1.29%，较大程度改变了肠道的菌群结构，并证实氟苯尼考有效防治黑身病。其次，养殖水体和颗粒饵料对斑石鲷肠道菌群也有一定影响，且养殖水体的影响高于颗粒饵料。本研究首次报道了斑石鲷肠道菌群结构，其研究结果为今后斑石鲷的健康养殖、疾病防控及其微生态学研究提供了参考依据和技术支撑。

趋化因子是一类能够吸引白细胞移行到感染部位的低分子量(8～10 ku)蛋白质，在炎症反应、非特异性免疫反应中具有重要作用。实验克隆了剑尾鱼2个趋化因子基因(CCL4、CCL19)c DNA序列，运用荧光定量PCR技术检测其在健康组织和嗜水气单胞菌感染后肝、脾中的表达情况。结果显示，剑尾鱼CCL4和CCL19开放阅读框长度分别为294和333 bp，分别编码97和110个氨基酸，推导氨基酸序列均含有趋化因子CC家族标志性的4个半胱氨酸残基，与其他物种尼罗罗非鱼、鼠、狗、人、鸡的氨基酸序列相似性比较，CCL4相似度分别为71.1%、33%、33%、31%、23.5%；CCL19相似度分别为62%、26.9%、24.5%、26.6%、27.8%。在检测的健康剑尾鱼8个组织中，CCL4和CCL19均有表达，其中CCL4和CCL19均在脾脏中表达量最高；CCL4在肌肉和肠中表达量较低，而CCL19则在心脏中表达量较低。经嗜水气单胞菌感染后，CCL4在剑尾鱼头肾中12 h表达量达到最高，在肝脏中24 h表达量最高；CCL19在头肾和肝脏中均在24 h时表达量最高。研究表明，趋化因子CCL4和CCL19可能参与剑尾鱼机体免疫调节反应，在抗嗜水气单胞菌感染过程中发挥了重要作用。

对杂交三倍体泥鳅(4n♀×2n♂)的胚胎染色体进行了C带及染色体荧光原位杂交(FISH)分析，首次探讨了杂交三倍体泥鳅C带特征，为准确鉴别染色体提供依据，研究了核糖体5.8S+28S r DNA在杂交三倍体泥鳅胚胎中期染色体上的数目和位置。C带结果表明，杂交三倍体泥鳅的染色体C带包括臂端C带和着丝粒C带，没有发现臂间C带。M染色体只有1号染色体既有臂端C带又有着丝粒C带，但臂端C带均比着丝粒C带大，信号也比着丝粒的强；而其他M染色体及SM染色体、T染色体只有着丝粒C带。FISH分析显示，核糖体5.8S+28S r DNA清楚地定位在杂交三倍体泥鳅中期染色体中部着丝粒染色体(M)的端部区域，在杂交三倍体泥鳅中期染色体上可以检测到三簇杂交信号。该结果从分子细胞遗传学层面进一步证实了杂交三倍体泥鳅是含有三套染色体组的遗传三倍体。

采用集中质量点法和网目群化法，结合数值模拟技术探讨了桩柱式围网网片单元在水流作用下的力学特性，着重分析了不同网片宽度和固定方式下网片单元的网线张力分布、节点偏移和网片系缚点受力特性。结果显示，水流作用下，桩柱式围网网片的最大张力主要分布于网片顶部和底部力纲的两侧，最大张力值与网片宽度成正比；网片的最大偏移部位主要分布于网片的上下端，最大偏移量与网片宽度成正比；系缚点最大受力出现在网片的顶端和底部，且其受力在数值上均远远大于中间系缚点；研究发现，随着系缚点数的增加，各系缚点的受力不断下降，网线张力和偏移量也迅速减小；当系缚点超过一定数量时，网线张力和偏移量将不再显著下降，表明存在一个临界系缚点数。本研究可为桩柱式围网工程的设计与安装提供参考。

以斑马鱼和巨噬细胞作为体内、外感染模型，比较无乳链球菌鱼源株GD201008-001与人源株A909的致病性差异，利用iTRAQ技术和质谱分析技术进行差异表达蛋白鉴定，以期为揭示无乳链球菌不同宿主来源株致病机制提供新思路。实验通过测定菌株GD201008-001、A909的斑马鱼半数致死量和巨噬细胞吞噬率，比较二者致病性差异；提取全菌蛋白，经iTRAQ试剂标记后进行质谱鉴定，质谱数据用软件Mascot 2.2和Proteome Discoverer 1.4进行查库(Uni Prot数据库)鉴定及定量分析，并对差异蛋白进行GO功能注释和KEGG通路分析。结果显示，GD201008-001毒力显著高于A909；通过iTRAQ分析两株菌差异表达蛋白，发现差异蛋白涉及的生物学功能较为广泛，在鉴定出的368个差异表达蛋白中，GD201008-001中上调表达蛋白193个(比值>1.5)，下调表达蛋白175个(比值<0.667)。生物信息学分析预测这些蛋白主要涉及26个生物学功能，14个通路，推测Clp X、Glm S和Cps IVK可能在两株菌致病性差异中发挥重要作用。本研究为阐明无乳链球菌不同宿主来源株致病性差异奠定了基础。

为了阐明山东省潍坊市一对虾养殖场发生日本囊对虾暴发性死亡的原因，采用分子生物学检测方法，对发病对虾进行了白斑综合征病毒(white spot syndrome virus，WSSV)、桃拉综合征病毒(Taura syndrome virus，TSV)、黄头病毒(yellow head virus，YHV)、传染性皮下及造血组织坏死病毒(infectious hypodermal and hematopoietic necrosis virus，IHHNV)、传染性肌肉坏死病毒(infectious myonecrosis virus，IMNV)、偷死野田村病毒(covert mortality nodavirus，CMNV)及急性肝胰腺坏死病(acute hepatopancreatic necrosis disease，AHPND)7种病原的检测，且对发病对虾进行了常规组织病理学观察。同时采用16S r DNA细菌鉴定方法及浸泡回接感染实验对分离自发病对虾体内的可疑病原菌进行了分子鉴定及毒力测试。结果显示，发病对虾样品核酸检测呈现WSSV强阳性，IHHNV和CMNV为弱阳性，其他4种病原为阴性。组织病理学观察发现，在对虾的胃、鳃等上皮组织中存在WSSV包涵体，头部肌肉纤维出现离散。对分离编号为2901、2902、2903的3株优势可疑病原菌鉴定结果显示，3株菌分别与印度格里蒙菌、交替单胞菌及溶藻弧菌相似，相似度分别为99%、99%及100%。攻毒结果显示，3株可疑病原菌的LC50分别为9.8×107、1.1×108与2.3×108 CFU/m L，各细菌毒力均较弱，非导致对虾出现暴发性死亡的病原。研究表明，导致本次日本囊对虾暴发性死亡的病因与混合感染病原WSSV、IHHNV、CMNV有关，其中WSSV感染是造成日本囊对虾暴发性死亡的主因，研究结果可为解析当前养殖日本囊对虾疾病暴发及其成因提供参考。

为了构建团头鲂耐低氧新品种，实验从鄱阳湖引进和挑选野生优良亲本为奠基群体F0，2009年–2011年通过群体选育获得F1，2011年再通过群体选育实现了F1到F2的传代。2012年，以鄱阳湖选育F2亲本和团头鲂"浦江1号"F9亲本为基础，经夏、秋季2次低氧胁迫，筛选出536尾耐低氧能力强的F2亲本，构成团头鲂耐低氧F2。2013年，挑选个体大、体形好的F2亲本(雌鱼50尾、雄鱼48尾)建立了24个F3家系群体(2♀×2♂群体22个、3♀×2♂群体2个)，共100个F3家系。对上述F3家系群体进行1龄阶段的低氧胁迫养殖，通过测定相应生长指标和耐低氧性状，共筛选出5个快速生长家系群体(A2、A3、A18、A19和A20)和6个生长较快的家系群体(A4、A6、A17、A25、A27、A28)，微卫星分析其分别归属于20个和28个家系。结果显示，团头鲂的生长性能指标与耐低氧性状呈正相关。在1龄阶段长时间低氧胁迫养殖条件下，团头鲂耐低氧F3中耐低氧能力强的家系的体质量显著大于耐低氧能力弱的家系，选育出的团头鲂耐低氧F3家系在2龄阶段同样保持了快速生长特征。本研究旨在建立团头鲂耐低氧F3新品系，以供后续团头鲂耐低氧新品种的选育。

为初步了解南澳岛白沙湾海藻养殖区鱼类资源状况，利用便捷式分裂波束式Simrad EY60科学探鱼仪，于2015年4月28日、12月2日与2016年4月19日对该海域进行3次声学调查，结果显示，3次调查中藻区内、外鱼类资源丰度密度分别为3.45/1.38×105、0.63/1.45×105、3.67/2.98×105尾/n mile2。藻区内春季鱼类资源量显著高于冬季，资源丰度密度随季节变化显著；藻区外资源丰度密度变化较小且均匀；藻区内、外鱼类资源丰度密度最高值出现于2～6 m水层，6～8 m次之，表、底层最小，资源丰度密度受深度影响显著。在海藻养殖期间，藻区内鱼类资源丰度密度较藻区外大且年变化明显，表明海藻生物量对鱼类资源量及其分布变化具有一定影响。本次调查通过声学评估技术对海藻养殖区鱼类资源进行初步评价，为其具有改善水质环境、恢复渔业资源的作用提供理论依据。

为获取2001年低温冻存栉孔扇贝感染牡蛎疱疹病毒(Os HV-1)变异株(ZK2001)基因组序列，并分析ZK2001与其他Os HV-1变异株的序列差异和系统发育关系，利用基于长片段PCR的基因组DNA的扩增和富集技术，获取2001年栉孔扇贝感染Os HV-1变异株的基因组DNA；再使用Illumina Hiseq 2500 PE250高通量测序平台对其测序。最后分析ZK2001与Os HV-1其他变异株基因组的序列差异和系统发育关系。测序数据组装后获得8个Scaffold。基因组变异分析结果显示，ZK2001与参考基因组相比存在328个SNP位点，SNP和序列插入/缺失变异是导致Os HV-1基因组序列变异的主要变异类型。系统发育分析结果显示，ZK2001变异株与分离自我国的Os HV-1变异株亲缘关系最近，与分离自欧洲的Os HV-1μvar及其相关变异株的亲缘关系最远，说明中国和欧洲分布Os HV-1间存在因地理隔离导致的遗传分化。研究表明，基于长片段PCR的DNA富集技术，可以有效地扩增和富集冷冻样本中Os HV-1基因组DNA，并应用于高通量测序。Os HV-1不同变异株基因组序列数据的获取和积累，将为其基因组尺度的基因变异、株系演化和系统发育关系等研究提供重要基础。

为了解Sox14基因在拟穴青蟹胚胎发育和性腺发育过程中可能起到的调控作用，实验从青蟹性腺转录组数据库中得到全长为2558 bp的Sp-Sox14 c DNA序列，该序列编码一个包含427个氨基酸的蛋白，包含一个HMG-box。进化树分析表明，Sp-Sox14与其他节肢动物的Sox14亲缘关系较近。实时定量PCR结果显示，Sp-Sox14在成蟹雌雄各组织中均有不同程度的表达，其中在卵巢和雄蟹心脏中的表达量最高。在胚胎发育过程中，SpSox14在复眼色素形成期的表达量显著高于其他时期。在性腺不同发育阶段，Sp-Sox14在卵黄发生前期(O2)的表达量显著高于卵巢其他发育阶段；而在精巢发育过程中，其表达量在成熟精子期(T3)高于精母细胞期(T1)和精子细胞期(T2)。推测其参与卵巢的前期发育以及精子成熟等过程。整胚原位杂交结果显示，Sp-Sox14在青蟹胚胎复眼色素形成期阳性信号定位于头部以及鄂足附近，在近孵化期定位于复眼附近，幼体孵出期则在头部仍有少量信号，暗示其与青蟹神经器官的形成以及体节附肢的发生有关。