海洋工程自动化技术是在海洋工程领域应用广泛且不断发展的技术，然而，海洋工程自动化技术面临着诸多挑战，包括复杂环境、安全可靠性、环境保护和法规伦理等方面的问题。为了应对这些挑战，需要进行技术创新，提高无人系统的感知能力和自主决策能力，开发高性能可靠自动控制系统和通信网络，提高能源效率和减少环境影响，并建立合适的法规框架和伦理准则。