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基于不同密度SNP面板的凡纳滨对虾AHPND抗性基因组预测准确性分析
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摘要:
为评估不同SNP标记密度对凡纳滨对虾AHPND抗性基因组预测准确性的影响,本实验对26个全同胞家系进行VpAHPND侵染,收集686尾个体的存活时间数据,对其中242尾个体利用液相芯片“黄海芯1号”(55.0KSNP)进行基因分型,基于A、G和H亲缘关系矩阵估计VpAHPND侵染后存活时间的遗传参数;采用随机和等距抽取方式,基于55.0KSNP构建了8个低密度SNP面板(40.0、30.0、20.0、10.0、5.0、1.0、0.5和0.1 K),利用GBLUP和ssGBLUP等方法预测VpAHPND侵染后存活时间的基因组育种值,利用交叉验证方法计算其预测准确性,并与BLUP方法进行对比分析。遗传参数估计结果显示,VpAHPND侵染后存活时间表现为高遗传力水平,估计值为0.68~0.79。在55.0KSNP密度下,针对242尾基因分型个体数据集(G242),利用BLUP、GBLUP和ssGBLUP方法获得的预测准确性分别为0.424、0.450和0.452,GBLUP和ssGBLUP比BLUP分别提升了6.13%和6.60%;针对686尾表型测定个体数据集(P686),利用BLUP和ssGBLUP方法获得的预测准确性分别为0.510和0.535,后者比前者提升了4.90%。对于8个低密度SNP面板,当SNP密度≥10.0 K时,基因组预测准确性变化幅度在G242和P686数据集中均较小(1.1%~1.8%);随着SNP密度自10.0K不断降低,基因组预测准确性在2个数据集中也不断降低,其中5.0K密度降幅为0.6%~2.6%、1.0K密度降幅为5.8%~11.0%、0.5K密度降幅为11.4%~17.2%、0.1K密度降幅为38.8%~41.6%。10.0K与55.0KSNP密度间基因组亲缘系数、GEBV的相关系数均高于0.99,表明利用10.0KSNP面板可以准确地预测同胞个体间的亲缘关系及其GEBV。研究表明,使用10.0SKNP面板对Vp AHPND侵染后存活时间进行基因组遗传评估可以得到与55.0KSNP芯片近似的预测准确性,为低密度SNP分型芯片设计提供了参考。
聚乙烯化工材料的结构特点和应用途径研究
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针灸穴位刺激联合主动康复训练对脑卒中偏瘫早期患者运动功能及血清总胆固醇(TC),血清三酰甘油(TG),高密度脂蛋白(HDL),低密度脂蛋白(LDL)水平的影响
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摘要:
目的 观察针灸穴位刺激联合主动康复训练对脑卒中偏瘫早期患者运动功能及血脂指标水平的影响。方法 以随机数字表法均分74例2022年1月-2023年1月在我院进行康复治疗的早期脑卒中偏瘫患者为A、B组,入院后均鼓励其展开主动康复训练,B组联合针灸穴位刺激,8周后对患者肢体运动功能、步行功能、血脂水平及生活自理能力进行对比分析。结果 B组较A组步行功能、肢体运动功能及生活自理能力均更高,血脂TG、TC、LDL水平均更高,HDL水平更低,对比均有统计学意义(P<0.05)。结论 对脑卒中偏瘫早期患者展开中医针灸穴位刺激联合主动康复训练干预,不仅有助于改善患者血脂指标水平,亦可以促使其提升运动功能及生活自理能力,值得被临床进一步运用及推广。