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基于不同密度SNP面板的凡纳滨对虾AHPND抗性基因组预测准确性分析 下载:76 浏览:490
摘要:
为评估不同SNP标记密度对凡纳滨对虾AHPND抗性基因组预测准确性的影响,本实验对26个全同胞家系进行VpAHPND侵染,收集686尾个体的存活时间数据,对其中242尾个体利用液相芯片“黄海芯1号”(55.0KSNP)进行基因分型,基于A、G和H亲缘关系矩阵估计VpAHPND侵染后存活时间的遗传参数;采用随机和等距抽取方式,基于55.0KSNP构建了8个低密度SNP面板(40.0、30.0、20.0、10.0、5.0、1.0、0.5和0.1 K),利用GBLUP和ssGBLUP等方法预测VpAHPND侵染后存活时间的基因组育种值,利用交叉验证方法计算其预测准确性,并与BLUP方法进行对比分析。遗传参数估计结果显示,VpAHPND侵染后存活时间表现为高遗传力水平,估计值为0.68~0.79。在55.0KSNP密度下,针对242尾基因分型个体数据集(G242),利用BLUP、GBLUP和ssGBLUP方法获得的预测准确性分别为0.424、0.450和0.452,GBLUP和ssGBLUP比BLUP分别提升了6.13%和6.60%;针对686尾表型测定个体数据集(P686),利用BLUP和ssGBLUP方法获得的预测准确性分别为0.510和0.535,后者比前者提升了4.90%。对于8个低密度SNP面板,当SNP密度≥10.0 K时,基因组预测准确性变化幅度在G242和P686数据集中均较小(1.1%~1.8%);随着SNP密度自10.0K不断降低,基因组预测准确性在2个数据集中也不断降低,其中5.0K密度降幅为0.6%~2.6%、1.0K密度降幅为5.8%~11.0%、0.5K密度降幅为11.4%~17.2%、0.1K密度降幅为38.8%~41.6%。10.0K与55.0KSNP密度间基因组亲缘系数、GEBV的相关系数均高于0.99,表明利用10.0KSNP面板可以准确地预测同胞个体间的亲缘关系及其GEBV。研究表明,使用10.0SKNP面板对Vp AHPND侵染后存活时间进行基因组遗传评估可以得到与55.0KSNP芯片近似的预测准确性,为低密度SNP分型芯片设计提供了参考。
体外传代对大口黑鲈蛙虹彩病毒毒株毒力的影响 下载:30 浏览:286
摘要:
为研究不同代次大口黑鲈蛙虹彩病毒(Largemouth bass ranavirus, LMBV)的病毒特性变化及毒力差异,采用攻毒试验、qPCR、TCID50及二代测序的方法,对LMBV分离株(LMBV-ZJDSS)F5、F35和F65进行致病性、组织中病毒载量变化、病毒滴度和不同代次病毒基因组测序,在LMBV全基组中筛选出4个毒力基因,并对不同地区毒株的毒力基因进行分析。结果表明:攻毒浓度为108.5 TCID50/mL时,F5、F35和F65代毒株15d内引起大口黑鲈(Micropterus salmoides)的死亡率分别为60%、25%和5%;F65代毒株最早产生细胞病变效应(cytopathic effect, CPE);大口黑鲈肝脏、脾脏和肠的病毒载量较高,不同代次毒株在各组织中均有分布,96h内F65代毒株在各器官组织的病毒载量呈上升趋势,48h内F5代毒株在各器官组织的病毒载量呈上升趋势;对F5和F65代毒株的全基因组测序分析显示,E3、TNFR和ICP18基因编码区未发生突变,遗传稳定性较高,ICP46基因编码区有一处氨基酸由天冬氨酸突变为酪氨酸。研究表明,通过病毒的连续传代,病毒致细胞病变的速度加快,病毒对大口黑鲈的致病性减弱,病毒的毒力有所下降,毒力下降的原因可能是编码ICP46蛋白的氨基酸发生突变,且不同地区LMBV毒株毒力基因差异主要集中在TNFR上。
日语翻译教学中翻转课堂有效性论述 下载:128 浏览:1444
摘要:
目前,我国教学模式的重大革新在于翻转课堂的出现,本文通过对日语翻译教学中翻转课堂的运用进行论述,从学生的积极性、学习兴趣、学生合作意识的培养等方面进行论述,最后阐明了在日语翻译教学中翻转课堂的具体运用,从综合素质的提高、教学方式的创新、教学理念的确立、指导学生学习等方面入手进行详细阐明,以供参考。
自媒体新闻传播对传统新闻传播的冲击及影响 下载:271 浏览:2725
摘要:
科技的发展和高科技设备的出现,使得新闻的传播更加的便捷和途径广泛化。当下,自媒体对新闻的传播正在逐渐影响甚至取代传统的新闻传播。自媒体的发展适应了新时代发展的节奏,也适应了人们对于新闻信息获取的快捷要求。在这样的冲击下,我们不得不去研究和反思自媒体新闻传播对传统新闻传播的冲击和影响,找出相应的对策。
关节镜手术治疗对早期膝骨关节炎的中期临床疗效 下载:103 浏览:1308
摘要:
目的:本文就关节镜手术治疗对早期膝骨关节炎的中期治疗效果进行探讨。方法:选取在本院进行治疗的早期膝骨关节炎患者62例作为研究对象,对患者进行分组处理,对照组31例应用注射玻璃酸钠手段,观察组31例应用关节镜手术治疗,进行疗效对比。结果:对术后疼痛状态进行评分,评估工具应用VAS量表,观察组患者评分显著更低(P<0.05);膝关节功能恢复情况进行评分时,评估量表选用HSS量表,结果表明观察组患者评分显著更高(P<0.05)。结论:在应用关节镜手术对早期膝骨关节炎患者进行治疗时,可以降低关节炎对患者带来的疼痛感,减少疾病对膝关节功能的影响,帮助患者尽早恢复正常的膝关节功能。
赫赛汀联合化疗药物在转移性乳腺癌治疗中的疗效观察 下载:196 浏览:1987
摘要:
探究使用赫赛汀联合化疗药物治疗转移性乳腺癌患者的临床意义和实际效果。方法:从我院所收治的大量转移性乳腺癌患者中随机选取100名作为本次实验的基本研究对象,将其每50名分为一组,使用赫赛汀治疗的组别取名为对照组,使用赫赛汀联合化疗药物的组别取名为实验组,其中,化疗药物主要包括:NVB和DDP,最后,将两组患者的实际临床治疗效果和患者对治疗过程的满意程度作为具体对比指标。结果:第一,由实验数据可得,实验组患者的临床治疗效率普遍比对照组更为明显;第二,实验组患者对治疗过程的态度也更为满意。结论:相较于赫赛汀的单独使用,加入某些化疗药物后的治疗方式对于患有转移性乳腺癌的患者具有更为明显的影响和意义。
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