环境行政公益诉讼诉前程序是检察机关对环境行政机关的违法行政行为或者不作为采取的通过发出检察建议督促环境行政机关整改的程序，具有督促行政机关依法履行保护生态环境和资源职责，正确行使法律监督职能，有效节约司法资源等重要作用。但在司法实践中，诉前程序存在诉前检察建议可操作性较弱、检察机关调查取证权缺乏强制性保障、诉前程序与诉讼程序衔接僵硬等问题，在实际的制度运行中应规范诉前程序中检察建议、保障诉前程序中检察机关调查核实权、优化诉前程序与诉讼程序的衔接来解决其运行困境，确保诉前程序能够最大程度的发挥独立价值，最大限度保护环境利益。