目的:利用Illumina Miseq测序平台探究病理黄腻苔、生理黄腻苔及健康薄白苔之间舌苔菌群门与属水平上菌群聚集情况。方法:采集病理黄腻苔、生理黄腻苔和健康薄白苔样本各50例，归为3组。对3组舌苔样本提取总DNA，并筛选出12份病理黄腻苔样本、12份生理黄腻苔样本及11份健康薄白苔样本，共35份，以Illumina Miseq PE300为测序平台进行高通量测序，并对测序数据进行处理和分析。结果:对35份样本测序后与数据库进行比对确定为12门、23纲、39目、66科、133属、246种的细菌。3组样本的群落构成有一定相似性，在门、属水平上都有相同的优势菌种，但3组样本在门、属水平上种群组成存在差异。结论:在门水平上，病理黄腻苔组与生理黄腻苔组在变形菌上存在差异；病理黄腻苔组与健康薄白苔组在变形菌和放线菌上存在差异；在属水平上，病理黄腻苔组与生理黄腻苔组在奈瑟氏菌和韦荣球菌上存在差异；病理黄腻苔组与健康薄白苔组在奈瑟氏菌、韦荣球菌、放线菌和嗜血杆菌上存在差异；生理黄腻苔组与健康薄白苔组在门与属水平上菌群结构无差异。