水产育种是世界各国竞相发展的热点研究领域，育种技术开发和优良品种培育充分体现了一个国家的综合创新实力和市场竞争能力。开展水产养殖生物的遗传育种研究，可提高种质资源开发强度和基因资源挖掘深度，发掘我国水产种业科技潜能和增强产业化应用水平。我国水产育种涵盖了完整的品种育成和扩繁推两大系统，已经成为推动水产养殖业绿色发展的重中之重，在保障优质蛋白稳定供给、提升种业强国竞争实力和改善国民饮食消费习惯等方面展示了杰出功效。随着生命科学特别是分子生物学和基因组学的飞速发展，我国水产育种取得了丰硕的科研成果，但也遇到了诸多核心瓶颈和制约因素。本文概括性总结了开展水产育种研究的重要意义，分析了当前我国水产育种研究的整体现状，凝练了亟需突破和解决的关键问题，提出了强化种质资源挖掘与高效利用、重视基础研究开展源头创新、研发前沿技术进行重点攻关、聚焦市场需求培育优良新品种等今后研究重点任务，形成了建设种质资源保藏体系、建成创新支撑平台、推进保护政策扶持、打造新型研发主体等对策建议，以期为我国引领世界水产育种研究和新时代渔业转型升级提供参考资料。