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基于转录组测序的花斑裸鲤SSR、SNP和InDel位点特征分析
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摘要:
为利用分子标记规模化开发与辅助花斑裸鲤(Gymnocypris eckloni)良种选育,以花斑裸鲤(2+龄)的鳃、肾脏和肝脏组织为材料,经总RNA提取和cDNA文库构建后采用Illumina Novaseq 2000平台进行转录组测序,并采用MISA和GATK3软件分析转录组的SSR、SNP和插入缺失标记(InDel)位点特征。结果表明:在486 221条Unigenes序列中共发现了128 727个SSR,出现频率为26.47%,平均每3.76 kb出现1个SSR;花斑裸鲤SSR包括6个重复类型,以单碱基和二碱基重复基元类型为主,分别占总SSR位点数的46.53%和42.45%,重复基元类型共77种,其中,A/T和AC/GT两种基元的出现频率最高,是花斑裸鲤SSR的优势重复基元;所有重复次数中出现次数最多的为5~15次,占所有SSR位点的87.52%;通过GATK3软件搜索得到399 080个SNP位点,转换类型多于颠换类型,分别占总SNP的56.29%和43.71%,转换类型中A/G发生频率略高于C/T,而颠换类型中A/T发生频率最高,C/G发生频率最低;InDel分析显示,从花斑裸鲤转录组Unigenes中共筛选出254 065个InDel位点,平均每1 903 bp出现1个InDel位点,且SNP位点和InDel位点均以含1个位点的Unigenes数最多。研究表明,花斑裸鲤转录组中SSR、SNP和InDel位点非常丰富,这些位点对花斑裸鲤种质资源鉴定、种群遗传学研究及保护管理具有重要价值。
青春型精神分裂症护理观察量表的应用与护理干预价值分析
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“OBE+PBL”理念下岩浆岩岩石学课程教学应用研究
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摘要:
本研究探讨了在岩浆岩岩石学课程中应用"OBE+PBL"教学理念的实践与效果。OBE(Outcomes-Based Education)即成果导向教育,强调以学生的学习成果为核心,通过反向设计教学过程,确保学生能够达成预期的学习目标。PBL(Problem-Based Learning)即问题导向学习,是一种以问题为基础,以学生为中心的教育方式,鼓励学生通过解决问题来学习知识和技能。本研究通过明确课程学习成果目标、设计问题导向的学习情境、采用线上线下混合式教学、强化课后延伸拓展功能以及实施形成性评价等策略,促进了学生的主动学习、团队合作和创新实践能力的发展。研究结果表明,"OBE+PBL"教学模式能够有效提升岩浆岩岩石学课程的教学质量和学生的学习效果,形成了良好的教学生态。
新形势下乡村初中叛逆期学生教育方法的探索
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“乡村振兴”乡镇公共文化工作的作用
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人工智能技术在电气自动化控制中的运用
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浅谈初中生青春期性教育的策略与方法
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