基于线粒体COⅠ基因序列的梭鲈野生群体遗传结构
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鲁翠云
孙志鹏
曹顶臣
耿龙武
那荣滨
吴学工
郑先虎
《水产研究进展》
2024年2期
摘要:
为了解梭鲈种群的遗传结构，实验利用线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ亚基（COⅠ）基因部分序列分析了中国6个和中亚2个群体的遗传差异，并与欧洲群体的单倍型序列进行了比较。结果在640 bp的COⅠ基因序列中检测到5个变异位点，定义了7种单倍型，发现Hap1为8个梭鲈群体的共享单倍型，且与欧洲群体的HapA相同，在中国群体所占比例（93.36%）高于中亚群体（72.58%）和欧洲群体（53.85%）；Hap2和Hap3是中国群体的特异单倍型，而Hap4～Hap7为中亚群体的特异单倍型。单倍型序列的聚类图和网络图均显示Hap1/A为梭鲈群体的原始单倍型，中国和中亚群体的特异单倍型相对于原始单倍型仅有1～2个位点的变异，属于Hap1/A的亚型，与欧洲群体的特异单倍型具有较大的差异。每个群体检测到1～4种单倍型，斋桑湖（ZS）群体单倍型最多，而中国的腾格里湖（NX）、兴凯湖（XK）和鸭绿江（YJ）群体仅有1个单倍型（Hap1）；塔什干（TS）群体的单倍型多样性（Hd）和核苷酸多样性（π）最高（Hd=0.514±0.069；π=0.000 79±0.000 11），其次是ZS群体，而中国梭鲈群体的多样性参数较低。AMOVA分析结果显示，梭鲈群体间遗传变异占20.74%，群体间遗传分化程度较高(0.15≤Fst=0.207 36<0.25)，TS群体与ZS群体和中国群体间的遗传分化极大(Fst>0.25)，中国群体中仅黑河（HH）群体与其他群体的遗传分化较大，而中国其他5个群体间无遗传分化。基于群体间遗传距离的系统进化树显示，来自中国的6个梭鲈群体与哈萨克斯坦的ZS群体聚为一支，而乌兹别克斯坦的TS群体独立为一支。研究结果为梭鲈群体的繁殖及放流管理提供了参考。
