医院在对政府提出的会计制度进行落实的过程中，由于双基础核算方法影响，很可能造成同样一笔业务在不同预算下产生差异，按照差异标准在后续核算过程中能否对其进行抵消可以直接将其分为时间性差异或是永久性差异。一般时间性差异更为复杂。为此本文就将对医院作为基础研究对象，进一步分析财务会计和预算会计差异的处理方式，希望对医院财务工作的顺利开展提供必要帮助和指导作用。