通过构建创新"结构-投入-绩效"的基础性SIP评价框架，从规模以上和大型工业企业两个层面，评价研究发现，内蒙古企业创新主体地位尚未形成且近年来有滑坡迹象，特别是企业研发经费投入与人员引进培养有待强化，专利申请量和新产品销售收入等创新效率有待显著提升。对此，提出健全鼓励企业主体的创新投入制度等若干关键措施，以改革制约内蒙古企业创新的体制机制。